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泰克生物—酵母与噬菌体展示CRO,纳米抗体与抗体药物开发专家

蛋白纯化完了干什么?这四种验证方法你必须知道!


回顾前文我们讲解了重组蛋白原核表达系统,以及常用到的蛋白表达标签。那么问题来了,蛋白纯化成功后,这些珍贵的蛋白能用来做什么呢?

1. WB

首先这是第一步,也是最容易忽略的一步。它可以帮你确定所纯化的是否是目的蛋白,别白忙活。简单来说就是通过凝胶电泳分离蛋白质,再将蛋白电转至膜上,利用抗体与目标蛋白的特异性结合进行显色检测,验证是否是目的蛋白。

步骤:制样(上样缓冲液煮样)→电泳(SDS PAGE分离蛋白)→转膜(PVDF膜/NC膜)→封闭(5% BSA或脱脂牛奶室温封闭1小时或4℃过夜)→孵一抗(4℃过夜孵育更省抗体)→孵二抗→显影(避光)

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表1 WB注意事项

 

1. CO-IP

想要确定两个蛋白在体内是否发生互作,CO-IP是你的首选。说白了,就是利用抗原抗体的特异性结合,固定于磁珠上的抗体能够拉出目标抗原以及互作蛋白。

步骤:预清(裂解液+磁珠除去非特异性结合)→孵育IP级一抗(裂解液中加一抗4℃过夜)→抓复合物(磁珠与一抗Fc区域结合)→洗脱(抗体A+蛋白X+蛋白Y)→WB验证(CO-IP的产物必须通过WB才能证明互作蛋白的存在


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表2 CO-IP注意事项

 

1. 染色质免疫共沉淀(ChIP)

ChIP和CO-IP原理类似,区别是研究对象是DNA和蛋白。是通过甲醛交联固定细胞内与DNA结合的蛋白,超声打断DNA后,用抗体富集目标蛋白及其结合的DNA片段。

步骤:交联(甲醛固定)→超声破碎(将DNA打碎200-1000 bp片段)→免疫沉淀(加入抗体和磁珠)→解交联(65℃加热,释放DNA)→DNA纯化→PCR分析


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表3 ChIP注意事项

 

1. Pull down

如果同时拥有蛋白A和蛋白B,想知道它们能不能直接互作,而不需要第三者,就选PuII down。一句话来说,就是将携带标签的蛋白A(如GST,His)固定于亲和磁珠上,随后与蛋白B或者细胞裂解液孵育,直接得知是否互作。

步骤(以GST为例):纯化蛋白(GST标签和含GST蛋白)→与谷胱甘肽磁珠孵育→与细胞裂解液(含猎物蛋白)孵育→洗脱→WB验证


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表4 Pull down注意事项

 

可靠的实验结果从来不是靠一种技术得到的,这张表可以帮助你快速做出决策,在实际应用中通常是选择几种进行验证,比如CO-IP实验确定的互作蛋白,还需要WB来验证。


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泰克生物科技(天津)有限公司建立了完善的蛋白表达纯化平台,致力于为全球科学家提供高质量的蛋白表达与纯化开发服务,包括表达系统选择(大肠杆菌、酵母、昆虫或哺乳动物细胞)、载体构建与设计、表达条件优化、下游纯化以及质量验证等一站式服务。我们顺应生命科学发展的需求,为客户开发创新性的生物学工具和治疗用蛋白,为客户的科研项目提供有力支持。

 

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