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噬菌体筛选详解


为什么选择M13噬菌体呢?首先我们先了解一下这几个主要噬菌体的特点。

一.噬菌体的选择

1.M13

他们通过出芽的方式,从宿主菌中释放(如大肠杆菌),而不杀死细菌,这种温和的方式利于大量生产。结构简单明确具体结构上篇已讲,且对温度、pH和多种去垢剂有较好的耐受性,便于进行多种苛刻的筛选条件(如模拟体内环境)。通常应用于抗体库筛选,蛋白质的相互作用研究等。

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 图1 M13噬菌体生命周期【1】

2.T7

T7噬菌体从感染到裂解宿主到释放子代病毒,仅需1-2小时。这使得筛选周期缩短,非常适合高通量筛选。主要是展示在衣壳蛋白10A上,应用于快速筛选cDNA库、快速鉴定相互作用蛋白,总之只有一个重点—快速。

3.T4

T4噬菌体具有双向展示系统:小衣壳蛋白SOC和衣壳蛋白HOC,这两个展示位点不依赖于细菌的分泌途径和信号肽,主要应用在多价疫苗开发(同时展示抗原和佐剂)、诊断试剂、环境耐受性要求高的筛选。

4.λ噬菌体

λ噬菌体是一种温和噬菌体但通过裂解宿主菌,释放出子代病毒,可以展示有毒性的蛋白质,相比于M13噬菌体,可以展示更复杂,分子量更大的蛋白,通常应用于构建cDNA表达库、展示大型酶或抗原。

总之,筛选抗体或进行常规肽库筛选,丝状噬菌体(M13) 是首选;需要展示更复杂、大型的蛋白质,可以考虑 λ噬菌体;需要快速得到结果(如高通量初筛),T7噬菌体非常有优势;开发疫苗或需要在极端条件下筛选T4噬菌体具有独特优势。

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图2 四种噬菌体【2】

二.文库的选择

既然已经选定噬菌体了,那么我们来考虑一下选择什么文库。文库一般分三种:天然、免疫、合成

1. 免疫库

免疫库是指从经过免疫的动物机体内,提取已经被激活后的B细胞mRNA,构建步骤上篇已讲,本次不再叙述。库容量可能比天然库小,但是特异性极强,筛选效率、抗体亲和力高,但是通常是非人源序列,需要进行人源化改造。

2.天然库

天然库指未经免疫的、健康的供体的组织中提取B细胞mRNA,构建原理步骤和免疫库类似。不同的是天然库多样性极高,代表了机体所能产生的全部体谱系,但亲和力较低通常需要体外亲和力成熟来优化。

3.合成库

完全通过化学合成DNA的方式人为构建。基于已知的抗体胚系基因框架,在互补决定区引入人为设计的随机突变。该库完全可控和可设计,主要应用在生成具有特殊性质的全人源抗体。


三.phagepro tech?筛选流程

结合:将噬菌体文库与固定后的靶标分子相孵育;

洗脱:使用缓冲液反复冲洗,收集与目标分子结合力强的噬菌体;

扩增:将洗脱得到的特异性噬菌体,再次感染大肠杆菌。

重复:扩增后的噬菌体再次参与筛选,一共重复3-5轮。

鉴定:筛选完之后,进行测序鉴定,并通过ELISA验证亲和力。

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图3噬菌体展示技术从建库到筛选全流程【3】

 

泰克生物科技(天津)有限公司以噬菌体展示、酵母展示抗体开发服务为核心业务,致力于为全球科学家提供高质量的靶向药物抗体发现、抗体人源化、ADC设计与合成、细胞杀伤实验、动物模型实验等相关技术服务,为客户的科研项目以及难治性疾病的药物单抗开发提供有力支持。

 

 

参考文献

1. Kehoe JW,Kay BK. Filamentous phage display in the new millennium. Chem Rev. 2005;105 (11):4056-72.

2. Hess KL,Jewell CM. Phage display as a tool for vaccine and immunotherapy development. Bioeng Transl Med. 2020;5 (1):e10142.

3. Anand T,Virmani N,Bera BC, et al. Phage Display Technique as a Tool for Diagnosis and Antibody Selection for Coronaviruses. Curr Microbiol. 2021;78 (4):null. 


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