核酸适配体修饰服务-泰克生物-酵母展示服务专家

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核酸适配体修饰服务

泰克生物凭借着深厚的抗体研究的相关经验，成功交付了许多的抗体研发成果，已成功构建了一套完善的适配体文库设计框架，并在此过程中积累了大量的项目实践经验。泰克生物专注于为客户提供高品质的核酸适配体筛选服务，并强有力地支撑客户在后续的核酸适配体合成、修饰、功能验证，以及针对特定分子的药物开发等下游科研活动中取得进展。此外，泰克生物还具备提供一站式服务的能力（从基因分析合成到体外筛选、适配体合成，再到亲和力测定，以及进行核苷酸适配体修饰，包括RNA和DNA核酸适配体修饰的全过程），以满足各类客户的多样化项目需求。通过其专业的核酸适配体修饰服务，泰克生物提供的适配体能够针对目标分子进行快速且精准的检测，其效率得到了大幅度提升。多种修饰基团可供选择，泰克生物确保每位客户都能获得高效且精确的核酸适配体成果，为客户的科研之旅增添助力。

泰克生物为客户提供的SELEX筛选技术服务，涵盖多种类型的样品（包括但不限于蛋白、多肽、氨基酸及小分子物质等）。公司的文库容量高达10^14级别，足以筛选出针对客户特定靶点的高亲和力核酸适配体。通过运用多种筛选策略，诸如磁珠-SELEX、细胞-SELEX及捕获-SELEX等，在经过6至10轮严格筛选后，能够鉴别出具有高特异性的核酸适配体。随后，采用NGS测序技术，可获得5至15条针对目标分子的适配体序列，并可根据获得的序列进行适配体的合成。依托其成熟的SELEX技术平台，筛选所得的核酸适配体展现了超乎寻常的结合亲和力，其范围可达nM至pM级别。泰克生物可以提供多种核苷酸适配体修饰，包括RNA和DNA核酸适配体修饰服务，在核酸适配体分子上引入化学基团或修饰物，这些化学修饰可以包括磷酸化、甲基化、糖基化等，与此同时，核酸适配体PEG修饰，多种荧光基团与猝灭基团等（包括但不限于Cy5、Cy7、FITC等）也可以被添加，并且泰克生物可以对修饰后的核酸适配体进行纯化，以确保其纯度和质量。泰克生物的科学家能够针对客户的具体实验需求，分析并设计合理的方案，提供个性化定制服务，确保每位客户的独特需求得到满足。

█ 核酸适配体修饰服务

适配体具备分子量低、稳定性卓越、便于化学合成及修饰的特性。核酸适配体进行修饰的核心意图在于提升其针对目标分子的结合力与特异性，进而优化其效能。经由化学手段修饰，能够调整核酸适配体的空间结构与电荷特性，进而影响其与目标分子的结合方式和亲和力。并且，这种化学修饰还能加固适配体的稳定性，延长其在生物体系中的半衰期时长。根据客户的需求，合成具有特定序列和结构的核酸适配体后，在核酸适配体分子结构中引入特定的化学基团或修饰成分，旨在转变其原有性质与功能。这些核苷酸适配体修饰方式可能涵盖核酸适配体PEG修饰，磷酸基化、甲基化、糖基化等多种形式。为确保修饰后的核酸适配体具备高纯度与高质量，需对其进行纯化处理。同时，借助BLI、SPR等实验技术，可以对修饰后的核酸适配体进行验证，以确认其结合力与特异性是否达标。将修饰后的核酸适配体作为生物传感器的识别组件，能够实现对特定目标分子的迅速且灵敏的检测。将修饰后的核酸适配体与药物分子相结合，形成具有靶向性的药物传递系统，实现药物的精准输送和释放。泰克生物适配体筛选、合成与修饰的流程见图1。

适配体筛选、合成与修饰流程图-泰克生物.png

图1 适配体筛选、合成与修饰流程图

█ 服务内容和周期

步骤

服务内容

周期

Step1：核酸适配体文库构建与筛选

(1) 固定序列与随机序列的合成，体外构建适配体文库；

(2) 生物素标记靶标作为筛选靶点；

(3) 适配体文库筛选与富集：PCR扩增富集+转录+跑胶回收，一般为6-10轮；

(4) 筛选产物进行NGS测序；

(5) 交付：适配体序列 5-15 条，实验报告，原始数据（包括NGS测序原始数据、胶图）

10-15周

Step2：

适配体合成、修饰和亲和力测定（可选）

(1) 根据序列进行适配体合成；进行单端或双端修饰；

(2) 适配体与靶点蛋白进行亲和力测定，BLI或SPR，进行KD测定

(3) 交付：实验报告，原始数据

6-8周

█服务优势：


多筛选靶点多样	文库库容庞大	多种修饰方式可选	SELEX技术平台成熟	实验记录详尽可追溯	一对一个性化方案定制	筛选方式多样	筛选轮次充足
涵盖蛋白、多肽、氨基酸、小分子等多种类型	达到10^14量级，足以筛选出针对客户靶点的核酸适配体	DNA核酸适配体修饰，核酸适配体PEG修饰，荧光基团修饰，猝灭基团修饰等	筛选所得核酸适配体的亲和力可达nM至pM级别	遵循QC质控标准，提供中英文实验报告及原始实验记录	包括筛选方案以及后续的验证方案等，满足各类客户的科研项目需求	磁珠-SELEX、细胞-SELEX、捕获-SELEX等多种方法	经过6至10轮压力筛选，确保获得高亲和力、高特异性的核酸适配体

核酸适配体修饰服务常见问题解答

什么是核酸适配体修饰服务？

答:核酸适配体(Aptamer) 是人工合成的单链DNA或RNA，由于其独特的三级结构，可以与靶标分子紧密结合，具有易于筛选、合成和化学修饰的特点。研究人员试图确定化学修饰是否可以促进修饰的适配体与其配体蛋白之间的相互作用。尽管共价键增强了最高的亲和力，但脱靶效应表明适配体中的治疗或诊断应用减少。天然存在的适配体在疾病治疗中已经达到了一个平台期，人们迫切地意识到亲和力增强现在必须来自新的修饰方法，例如疏水基团、氨基酸、正电荷和硫代磷酸盐。重要的是，扩大适配子表位，即增加修饰的适配子和蛋白质之间的接触面积，这项技术的发展为基因工程领域带来了新的可能性，将为疾病诊断和治疗等领域带来更多的机会和希望。
核酸适配体修饰服务中，增强共价键结合亲和力的策略有那些？

答：核碱基可以用多种官能团进行修饰，以提高适配体和蛋白质之间的亲和力。开发了碱基附加的碱基以增强修饰适配子的结合亲和力。除了上述修饰外，研究人员还通过 SELEX 后修饰将氨基酸引入 TBA 的核碱基。他们证明这些修饰可以提高结合亲和力并增强抗凝活性。核酸核糖部分的修饰，如 2'-氟（2'-F）、2'-氟阿拉伯糖核酸、可以增强结合亲和力。通常，未修饰的适配子对靶标的亲和力有限，而 2'-氟（2'-F）优化的适配子表现出优异的结合亲和力和核酸酶抗性。与未修饰的 Adipo8 相比，他们发现 PS 修饰的适配子对靶标表现出更高的结合亲和力，并且在体外表现出高特异性。此外，修饰的适配体 Adipo8 有效抑制脂肪组织的成脂分化，显示出治疗肥胖的潜力。
核酸适配体修饰服务的下一个挑战是什么？应该如何应对？

答：下一个挑战是了解哪些核苷酸类似物需要哪种 DNA/RNA 聚合酶，以最大限度地提高 PCR 产量，从而提高适配体筛选的成功率。就像 SOMA 一样，氨基酸样侧链的疏水性被证明在增加适配体和靶蛋白之间的疏水相互作用方面具有巨大潜力。大多数化学修饰阻碍了 SELEX 文库构建过程中的完整性、高亲和力序列的富集以及最终的测序程序。在 SELEX 后程序中，化学修饰的选择通常是不受限制的，这显著扩大了修饰适配体的多样性。最后，高通量筛选方法，如 DNA 微芯片、人工智能和组合化学，可能涉及提高 SELEX 后修饰的能力。因此，有必要寻求一种有效的虚拟预测策略来优化适配体的修饰类型和修饰位点，以实现高结合亲和力。基于上述数据，研究人员可以进一步构建和训练人工智能模型，以预测不同修饰的适配子在不同位点的巨大结合亲和力。
如何保持选定适配体的血清稳定性？

答：人们对使用适体开发治疗剂越来越感兴趣。然而，作为寡核苷酸，适体易受核酸酶降解的影响；较差的血清稳定性可能对体内功能产生负面影响。修饰的核苷酸已用于阻止核酸酶降解。然而，很少有研究报告选定的适体的血清稳定性。有一项研究中，检查了各种化学修饰对照寡核苷酸序列在冷冻人、新鲜小鼠和新鲜人血清中孵育后的稳定性的影响。令人惊讶的是，发现fYrR的稳定性仅与DNA大致相同。有趣的是，包含一个3分倒置的dT帽对血清稳定性只有适度的影响，在一项研究中，添加一个倒置的dT帽使得由DNA组成的分子比其fYrR对应物更稳定。到目前为止，完全修饰的寡核苷酸具有最长的半衰期。这些组合物甚至在长时间孵育后在人血清中也几乎没有降解。
核酸适配体修饰的效率问题以及修饰特异性问题，及其解决方案？

答：当我们在核酸适配体上添加化学基团进行某些修饰时，我们可能会发现化学基团的修饰效率不高，从而造成合成的适配体出现浪费，修饰后的产量低等问题。面对修饰后效率底下这个问题，我们通过优化修饰反应条件，比如说调整反应温度、pH值、反应时间以及修饰剂的浓度等，来帮助我们提高化学基团或者其他物质对适配体的修饰效率。同时，我们还要确保整个反应体系的纯净度，减少体系中杂质对我们的干扰。除了修饰效率低等问题，可能修饰的基团没有出现在我们预期的地点，出现在其他位置，这样会造成核酸适配体的特异性降低，所以，我们选择修饰时，就要对修饰序列进行分析，确保最后结果的准确性。泰克生物多年深耕于核酸适配体修饰平台，用丰富的筛选修饰平台和优秀的技术服务为客户一站化解决问题。

什么是核酸适配体修饰服务？

答:核酸适配体(Aptamer) 是人工合成的单链DNA或RNA，由于其独特的三级结构，可以与靶标分子紧密结合，具有易于筛选、合成和化学修饰的特点。研究人员试图确定化学修饰是否可以促进修饰的适配体与其配体蛋白之间的相互作用。尽管共价键增强了最高的亲和力，但脱靶效应表明适配体中的治疗或诊断应用减少。天然存在的适配体在疾病治疗中已经达到了一个平台期，人们迫切地意识到亲和力增强现在必须来自新的修饰方法，例如疏水基团、氨基酸、正电荷和硫代磷酸盐。重要的是，扩大适配子表位，即增加修饰的适配子和蛋白质之间的接触面积，这项技术的发展为基因工程领域带来了新的可能性，将为疾病诊断和治疗等领域带来更多的机会和希望。
核酸适配体修饰服务中，增强共价键结合亲和力的策略有那些？

答：核碱基可以用多种官能团进行修饰，以提高适配体和蛋白质之间的亲和力。开发了碱基附加的碱基以增强修饰适配子的结合亲和力。除了上述修饰外，研究人员还通过 SELEX 后修饰将氨基酸引入 TBA 的核碱基。他们证明这些修饰可以提高结合亲和力并增强抗凝活性。核酸核糖部分的修饰，如 2'-氟（2'-F）、2'-氟阿拉伯糖核酸、可以增强结合亲和力。通常，未修饰的适配子对靶标的亲和力有限，而 2'-氟（2'-F）优化的适配子表现出优异的结合亲和力和核酸酶抗性。与未修饰的 Adipo8 相比，他们发现 PS 修饰的适配子对靶标表现出更高的结合亲和力，并且在体外表现出高特异性。此外，修饰的适配体 Adipo8 有效抑制脂肪组织的成脂分化，显示出治疗肥胖的潜力。
核酸适配体修饰服务的下一个挑战是什么？应该如何应对？

答：下一个挑战是了解哪些核苷酸类似物需要哪种 DNA/RNA 聚合酶，以最大限度地提高 PCR 产量，从而提高适配体筛选的成功率。就像 SOMA 一样，氨基酸样侧链的疏水性被证明在增加适配体和靶蛋白之间的疏水相互作用方面具有巨大潜力。大多数化学修饰阻碍了 SELEX 文库构建过程中的完整性、高亲和力序列的富集以及最终的测序程序。在 SELEX 后程序中，化学修饰的选择通常是不受限制的，这显著扩大了修饰适配体的多样性。最后，高通量筛选方法，如 DNA 微芯片、人工智能和组合化学，可能涉及提高 SELEX 后修饰的能力。因此，有必要寻求一种有效的虚拟预测策略来优化适配体的修饰类型和修饰位点，以实现高结合亲和力。基于上述数据，研究人员可以进一步构建和训练人工智能模型，以预测不同修饰的适配子在不同位点的巨大结合亲和力。
如何保持选定适配体的血清稳定性？

答：人们对使用适体开发治疗剂越来越感兴趣。然而，作为寡核苷酸，适体易受核酸酶降解的影响；较差的血清稳定性可能对体内功能产生负面影响。修饰的核苷酸已用于阻止核酸酶降解。然而，很少有研究报告选定的适体的血清稳定性。有一项研究中，检查了各种化学修饰对照寡核苷酸序列在冷冻人、新鲜小鼠和新鲜人血清中孵育后的稳定性的影响。令人惊讶的是，发现fYrR的稳定性仅与DNA大致相同。有趣的是，包含一个3分倒置的dT帽对血清稳定性只有适度的影响，在一项研究中，添加一个倒置的dT帽使得由DNA组成的分子比其fYrR对应物更稳定。到目前为止，完全修饰的寡核苷酸具有最长的半衰期。这些组合物甚至在长时间孵育后在人血清中也几乎没有降解。
核酸适配体修饰的效率问题以及修饰特异性问题，及其解决方案？

答：当我们在核酸适配体上添加化学基团进行某些修饰时，我们可能会发现化学基团的修饰效率不高，从而造成合成的适配体出现浪费，修饰后的产量低等问题。面对修饰后效率底下这个问题，我们通过优化修饰反应条件，比如说调整反应温度、pH值、反应时间以及修饰剂的浓度等，来帮助我们提高化学基团或者其他物质对适配体的修饰效率。同时，我们还要确保整个反应体系的纯净度，减少体系中杂质对我们的干扰。除了修饰效率低等问题，可能修饰的基团没有出现在我们预期的地点，出现在其他位置，这样会造成核酸适配体的特异性降低，所以，我们选择修饰时，就要对修饰序列进行分析，确保最后结果的准确性。泰克生物多年深耕于核酸适配体修饰平台，用丰富的筛选修饰平台和优秀的技术服务为客户一站化解决问题。

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