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蛋白核酸适配体筛选服务

泰克生物专业的研发团队致力于抗体发现方面的研究,在适配体体外筛选、亲和力测定等方面拥有丰富的经验。泰克生物提供的核酸适配体体外筛选服务,能够迅速且精确地为客户挑选出高特异性的适配体,从而助力客户实验项目实现成本的节约。客户只需要提供靶标蛋白的相关序列,泰克生物采用指数富集(SELEX筛选技术),该技术能够区分不同细胞并检测两类细胞间的分子水平差异,就可以针对靶标蛋白进行蛋白药物适配体筛选,从而得到针对靶标蛋白的适配体序列(包括但不限于RNA、DNA、寡核苷酸序列)。此外,泰克生物也能够为客户提供一站式服务,从基因分析合成、适体体外筛选、适配体合成,到亲和力测定,以满足客户的多样化需求,为客户后续的适配体功能验证及靶向特定分子药物的开发等下游研发工作提供有力支持。

泰克生物能够为客户提供用于适体开发的基于不同类型的样品的SELEX筛选技术服务(包括但不限于蛋白、多肽、氨基酸、小分子物质、等),且泰克生物的文库库容达10^13-10^14,足够筛选出针对客户靶点的高亲和力核酸适配体,利用多种筛选方式(包括但不限于磁珠-SELEX、细胞-SELEX、捕获-SELEX等)经6-10轮压力筛选后,能够筛选出高特异性的核酸适配体,NGS测序之后获得针对靶标分子的5-15条适配体序列。在成熟的SELEX技术平台基础上,筛选所得的核酸适配体展现出超越常规适配体的结合亲和力,其级别可达nM至pM,针对蛋白靶标的适体亲和力可以达到pM级别。

泰克生物还为客户提供全面的下游服务,涵盖蛋白药物适配体筛选后的适配体合成、亲和力测定等,全方位支持客户的实验进程。泰克生物的科学家能够针对客户的具体实验需求,分析并设计合理的方案,提供个性化定制服务,确保每位客户的独特需求得到满足。

 

█ 蛋白核酸适配体筛选服务

 

通过适配体体外筛选进行蛋白药物适配体筛选,能够获得识别特定的靶标分子的适配体,它也是药物开发的一种重要工具。借助SELEX筛选技术,与靶标物质高度结合的适配体能够被泰克生物从庞大的随机单链核酸序列库中获得,客户只需提供靶标蛋白的序列号或蛋白样品(蛋白样品需不含大标签;缓冲液无游离氨基;PBS缓冲液,不含Tris;蛋白纯度> 95%;蛋白0.5-1mg,浓度1mg/ml),泰克生物将对靶标蛋白进行SDS-PAGE检测,通过蛋白文库的制作与靶蛋白筛选,解离筛选的适配体后,进行重复洗脱筛选,经PCR,NGS测序,得到针对靶点蛋白的适配体序列,其具体流程见图1。


蛋白核酸适配体筛选服务-泰克生物.png

图1 基于SELEX技术的核酸适配体筛选服务流程

 

█ 服务内容和周期

 

步骤

服务内容

周期

Step1:核酸适配体筛选

(1) 客户提供蛋白样品;

(2) 生物素标记目标蛋白作为筛选靶点;

(3) 适配体文库筛选与富集:PCR扩增富集+转录+跑胶回收,一般为6-10轮;

(4) 筛选产物进行NGS测序;

(5) 交付:适配体序列 5-15 条,实验报告,原始数据(包括NGS测序原始数据、胶图)

 10-15周

Step2:

适配体合成和亲和力测定(可选)

(1) 根据序列进行适配体合成;

(2) 适配体与靶点蛋白进行亲和力测定,BLI或SPR,进行KD测定

(3) 交付:实验报告,原始数据

4-5周

 

█ 服务优势

 


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广泛的靶点

庞大的文库库容

成熟的SELEX技术平台

实验记录全程可追溯

一对一个性化方案定制

多样化的筛选方式

严格的多轮压力筛选

广泛的应用领域

涵盖蛋白、多肽、氨基酸、小分子等多种类型

高达10^14,确保筛选出针对客户特定靶点的核酸适配体

筛选得到的核酸适配体具有nM至pM级别的高亲和力

遵循QC质控标准,提供中英文实验报告及原始实验记录

包括筛选方案以及后续的验证方案等,满足各类客户的科研项目需求

如磁珠-SELEX、细胞-SELEX、捕获-SELEX等

经过6至10轮筛选,确保获得高亲和力、高特异性的核酸适配体

适用于蛋白、核酸、多肽、纳米材料等分子的相互作用分析


推荐服务

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蛋白核酸适配体筛选服务常见问题解答

  • 在蛋白核酸适配体筛选服务中,如果我们遇到了筛选效率低的问题,怎样提高效率?

    答:在蛋白核酸适配体筛选服务中,核酸筛选的效率及其重要,筛选效率决定着我们能否得到高亲和力的适配体。但是在某些筛选实验中由于适配体文库设计不合理等原因影响,导致整个筛选服务过程中,我们的筛选周期过长,筛选的成本提高,并且我们最后得到的适配体可能亲和力不高,为了提高核酸适配体服务的筛选效率,泰克生物首先通过提高文库多样性,构建出序列更多的随机的寡核苷酸文库,这样实验中就可以增加筛选的效率,更有可能获得高亲和力适配体。接着泰克生物改进了适配体的筛选方法,技术人员采用HPCE等新技术,帮助完成高效率分离和筛选服务,这些新的技术手段和之前的技术相比,分离的速度更快、并且需要的人力减少。同时,泰克生物的技术人员也通过优化筛选条件,如靶标浓度、孵育时间、洗涤次数等,来减少筛选过程中轮数,缩短筛选的周期时间。我们也引进了新的筛选策略,比如双靶标筛选、竞争性筛选等,帮助提高筛选效率。

  • 什么是蛋白质核酸适配体?

    答:核酸与蛋白间的相互作用,构成了生命活动的基础。适配体,作为通过体外进化技术获得的独特单链寡核苷酸分子,具备与各种物质发生反应的能力。改变其结构能够改变它们和蛋白之间的作用,从而进一步波及相关的细胞功能。近年来,随着适配体与蛋白质相互作用研究的不断深入,基于这一相互作用的分析技术得到了发展。适配体是通过SELEX技术从核酸分子文库中体外选择的单链RNA或DNA分子,通过高亲和力特异性筛选出结合蛋白的适配体。该适配体因其可以重复使用、容易进行固定、工业化生产产品间差异小等原因,在传感器领域被研究人员使用。适配体能将造影剂送到MR成像的的需要位置,在递送放射性核素探针方面潜力巨大,被标记的适配体还用于成像分析,用于与退行性疾病事件的调节和研究。还有研究人员发现蛋白质通过转化为由结合 TfR 受体的适体的 ProSNA 来增强向大脑的传达。

  • 在蛋白核酸适配体筛选服务中,如果我们遇到了筛选特异性低的问题,怎样提高特异性?

    答:在蛋白核酸适配体筛选服务中,适配体的特异性决定着产品能否正常交付,由于筛选的过程中会出现非特异性结合、或者靶标污染、筛选条件不严格等问题,会导致获得的适配体无法识别目的蛋白,进而去影响我们产品的后续应用。泰克生物通过反复多次的筛选和PCR扩增,将能够与目的蛋白结合的适配体序列富集起来。这一个过程中,泰克生物的研究人员一步一步增加了筛选的严格性,来提高适配体的特异性。除了上述办法,我们还可以进行负筛来提高特异性,通过在筛选过程中加入与目标蛋白结构相似但不发生结合的分子作为负筛靶标,这样负筛有利于帮助去除那些发生非特异性结合的序列,进而提高特异性。

  • 在蛋白核酸适配体筛选服务中,如果我们遇到了筛选的适配体稳定性差的问题,怎样提高稳定性?

    答:在整个服务过程中,我们可能会遇到筛选出的适配体不稳定的情况,结构容易被周围的环境因素所影响,会导致它的应用效果不佳,甚至出现没有反应的情况。针对上述情况,泰克生物通过对适配体进行化学修饰,比如我们引入了能够抵抗核酸酶降解的化学基团,来帮助我们提高核酸适配体在机体内的稳定性。同时,为了提升其稳定性并降低因结构变动引发的失活风险,我们还对核酸适配体的二级乃至三级结构进行了相应的优化调整。同时我们也进行了一个缓冲液的优化,选择适合适配体结构的缓冲液体系,帮助适配体维持结构稳定。

  • 蛋白核酸适配体的优点和缺点有什么?这个技术的应用范围包括什么?

    答:蛋白核酸适配体技术能够高特异性、高亲和力地识别并结合目的靶标蛋白,这种蛋白-适配体的结合程度甚至和抗体与抗原的结合程度不相上下。核酸适配体可以通过现有的成熟的DNA合成技术、PCR扩增技术或RNA的体外转录技术等在体外完成快速、方便的合成,并且合成的成本相对较低,这种合成方便进行化学修饰,来满足科研人员在各个方面的不同应用。核酸适配体的分子量较小,具有良好的稳定性,在各种化学溶剂和高温下也能保持原来的结构,同时,因其分子量小可以减少副作用。除此之外,核酸适配体的靶标分子范围广泛,各种生物大分子,都可以是它的靶标分子。而且它的缺点是,可能被酶降解,也可能在通过肾脏时被清除,并且,筛选难度大,时间长。蛋白核酸适配体的主要应用于药物筛选、靶向位点的基因治疗以及某些疾病的基因诊断中。

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