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细胞核酸适配体筛选服务
泰克生物在药物抗体领域深耕多年,抗体开发、适体体外筛选、亲和力成熟等方面都积累了深厚的经验,能够提供多种样品类型的适体体外筛选服务,如蛋白、多肽、氨基酸、小分子物质、细胞和细菌、金属离子等。泰克生物能够提供定制化的适体体外筛选服务,确保高效、精准且快速地筛选出客户所需的适配体序列。此外,泰克生物能够为客户提供涵盖核酸适配体筛选的上下游服务,从基因分析合成、适体体外筛选、适配体合成,到亲和力测定。对后续的适配体功能验证(包括但不限于亲和力验证、竞争ELISA验证、体外靶向细胞功能性验证(例如:核酸适配体的体外识别和抑制功能验证、体外流式阻断功能等)、体内功能验证(例如:适配体的体内靶向抑制功能验证、信号通路阻断功能验证等))提供有力支持,为客户的后续工作,如靶向特定分子药物的开发等下游研发打好基础。
泰克生物提供基于SELEX技术的适配体体外筛选服务,涵盖了广泛的样品类型,并采用了多样化的筛选方法,如磁珠-SELEX、细胞-SELEX(即Cell-SELEX,常用于细胞靶标的筛选)及捕获-SELEX等,以满足不同样本的特定需求。泰克生物庞大的库容量(10^13-10^14),保障了筛选的广度,足以获得针对客户靶点的核酸适配体,经过多轮筛选(一般为6-10轮)之后,确保筛选出的核酸适配体具备高特异性,其结合亲和力可达nM至pM级别,远超传统适配体的标准。根据每个项目的不同需求,泰克生物的科学家团队能够策划出最优的筛选方案,确保满足客户的要求。
█ 细胞核酸适配体筛选服务
核酸适配体作为一种功能核酸,具有诸多优点,基于其高特异性,来精确锁定靶标分子,有效避免非特异性结合的干扰。通过SELEX技术,可以迅速且大量地合成适配体,无需繁琐的生物制备流程。核酸适配体能在多种环境条件下保持其结构与功能的完整性,同时拥有更高的热稳定性和较低的免疫原性。此外,由于其分子量相对较小,细胞特异性适配体筛选出的适配体更易穿透细胞和组织屏障,迅速抵达作用位点。
SELEX技术的核心在于体外化学合成一个单链寡核苷酸库,并通过反复的筛选与扩增步骤,最终获得与靶标物质高度亲和的核酸适配体。而Cell-SELEX则专注于细胞、细菌等靶标物质的筛选,利用离心、沉淀等手段有效分离并去除未结合的适配体,从而开展细胞特异性适配体筛选,把正向筛选和不表达靶蛋白的细胞的负向筛选相互交替,最终获得适配体,其具体流程见图1。
图1 基于SELEX技术的细胞特异性适配体筛选服务流程
█ 服务内容和周期
步骤 | 服务内容 | 周期 |
Step1: 核酸适配体筛选 | (1) 客户提供细胞; (1) 适配体文库筛选与富集:PCR扩增富集+转录+跑胶回收,一般为6-10轮; (2) 筛选产物进行NGS测序; (2) 交付:适配体序列 5-15 条,实验报告,原始数据(包括NGS测序原始数据、胶图) | 10-15周 |
Step2: 适配体合成和流式验证(可选) | (1) 客户提供细胞 (2) 根据序列进行适配体合成; (3) 适配体与细胞进行流式验证; (3) 交付:实验报告,原始数据 | 4-5周 |
█ 服务优势
多种筛选靶点可选 | 庞大的文库库容 | 成熟的SELEX技术平台 | 实验记录全程可追溯 | 一对一个性化方案定制 | 多样化的筛选方式 | 严格的多轮压力筛选 |
蛋白、多肽、氨基酸、小分子、细胞与细菌等 | 高达10^14,确保筛选出针对客户特定靶点的核酸适配体 | 筛选得到的核酸适配体流式验证阳性率高 | 遵循QC质控标准,提供中英文实验报告及原始实验记录 | (包括筛选方案以及后续的验证方案等),满足各类客户的科研项目需求 | 如磁珠-SELEX、细胞-SELEX、捕获-SELEX等 | 经过6至10轮筛选,确保获得高亲和力、高特异性的核酸适配体 |
答:适配子,包括 RNA适配子和DNA 适配子,通过高特异性和亲和力与多种靶标结合。适配子是通过一种新的细胞选择过程 (cell-SELEX) 选择的,其中整个完整细胞用作靶标,而另一种相关细胞系用作阴性对照。cell-SELEX 能够生成多个适配体用于靶细胞的分子识别,并且在发现所选适配体的细胞表面结合分子方面具有显著优势。参与细胞表面靶标的能力也使该领域进入了靶向递送治疗剂的领域,因为核酸与小分子药物、蛋白质毒素、脂质体或其他纳米颗粒的偶联相对简单。它作用于天然结构中的蛋白质,其中细胞膜上保守的生物特性不受蛋白质纯化程序的影响。此外,不需要事先了解某些其他蛋白。泰克生物出来可以提供细胞核酸适配体筛选服务外,还可以提供蛋白定制和以及噬菌体展示服务。
答:血清稳定性一直是基于核酸的分子应用的一个问题。因此,科学家比较了基于 RNA和DNA的适配体的稳定性。结果表明DNA适配体的血清稳定性远优于RNA适配体。RNA适配体成本高且血清稳定性差,体内使用我们选择DNA适配体。未修饰的RNA在血浆中被清除只需要几秒,而 DNA 被清除需要半小时到一小时。RNA适配体在与大鼠和人血清孵育后迅速降解。相比之下,DNA 适配体在人和大鼠血清中分别稳定60 和30分钟。因此,如果需要高的血清稳定性,大部分研究人员选择DNA适配体,虽然RNA适配体往往展现出相较于其对应的DNA适配体更高的结合力,但科学家仍不懈努力,研发了多种化学改良手段,旨在增适配体在血清中的稳定性。
答:我们通常结合使用细胞分析、siRNA 敲低和工程细胞系来进一步验证靶标的特异性。我们可以通过标准化流程筛选出具有高特异性的适配体。还可以通过阴性或敲除细胞系进行,并得到体外结合实验的支持。根据泰克生物自己的经验,我们建议使用流式细胞术来测试和验证细胞上的适配子功能,与上述基于大量细胞的检测不同,流式细胞术允许单独询问细胞群中的每个细胞,从而查看观察到的染色是针对样品中的所有细胞还是细胞亚群。此外,有许多经过充分验证的荧光标记抗体可用作对照,它可以验证靶标,还可以比较染色能力。
答:适配子来源于称为 SELEX的迭代过程。适配子具有高亲和力、优异的特异性和低毒性。此外,它们稳定且易于合成、修改和操作。尽管适配子在体外非常有效,但大多数适配子在没有外部帮助的情况下不能被细胞直接吸收。截至目前,仅有极少数适配子能够成功被细胞摄取。这些事实都表明了内化能力在体内的应用比较困难。为了提升这一能力,我们采用各种手段去优化条件,诸如采用单核苷酸拼接后组装等前沿技术。也可以对其进行改造,如添加氟、氨基等基团,可以改变其理化性质,提高稳定性,促进适配体与细胞膜的相互作用,帮助适配体内化。
答:一致的细胞培养维持对于 Cell-SELEX 的成功至关重要,例如在所有选择周期、传代次数和生长条件下保持一致的汇合度。细胞生长时间延长或培养条件差会影响状态和表达,因此会导致效率降低。此外,为了消除寡核苷酸的非特异性结合,重要的是在与随机寡核苷酸文库孵育之前用 tRNA、鲑鱼精子DNA 或多聚封闭靶细胞。需要注意的是,胰蛋白酶处理会剥离细胞表面标志物,因此需要通过与培养基孵育至少2小时来回收细胞。此外,如果使用贴壁细胞作为适配体发育的细胞悬液,则应轻轻摇动以防止发生粘附。整个过程在4-37℃的范围内进行,增加选择温度和延长时间会增加适配体内化到细胞中的可能性。
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